在CI论坛上有讨论，地址：http://codeigniter.org.cn/forums/forum.php?mod=viewthread&tid=17866

本人也遇到这样的问题，各种方法都试过了，最终找到大神提供的native session类，问题解决了。
具体做法

1，下载Native session类，地址：http://codeigniter.org.cn/forums/forum.php?mod=viewthread&tid=4007

2，将Nsession.php 添加到application的libraries目录下

3，然后修改application/config/autoload.php文件

// 添加Nession
$autoload['libraries'] = array('database','Nsession');

4，就可以在application/controllers的控制器使用了

$this->nsession->set_userdata($user);
$this->nsession->sess_destroy();